Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN23Q96B33 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLDN23Q96B33 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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