Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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