Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms