Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP1Q86W92 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms