Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REEP3Q6NUK4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms