Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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