Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SDK2Q58EX2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms