Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms