Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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