Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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CDSNQ15517 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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