Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHBQ15464 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHBQ15464 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SHBQ15464 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHBQ15464 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHBQ15464 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms