Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SYCP1Q15431 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SYCP1Q15431 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SYCP1Q15431 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SYCP1Q15431 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SYCP1Q15431 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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