Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLR1Q15399 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms