Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABEP1Q15276 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABEP1Q15276 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABEP1Q15276 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABEP1Q15276 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABEP1Q15276 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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