Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECTIN1Q15223 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms