Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNIP1Q15025 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms