Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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LAPTM4AQ15012 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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