Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3AQ14156 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms