Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNW1Q13573 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms