Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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