Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms