Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 365.4 ms