Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms