Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms