Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRB1P82279 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRB1P82279 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms