Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ASIC1P78348 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms