Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARF6P62330 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms