Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME5P56597 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME5P56597 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME5P56597 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME5P56597 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME5P56597 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms