Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms