Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPFP49454 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CENPFP49454 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CENPFP49454 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPFP49454 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CENPFP49454 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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CENPFP49454 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPFP49454 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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