Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms