Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RORAP35398 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RORAP35398 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms