Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFNP31947 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFNP31947 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFNP31947 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFNP31947 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms