Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms