Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PEX2P28328 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms