Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms