Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN8P19075 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms