Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms