Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms