Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBL4AP11441 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms