Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTMAP06454 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms