Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAPLNO95428 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms