Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms