Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DENRO43583 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms