Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 AAAS-220ENST00000552876 2016 ntTSL 215.63■□□□□ 0.096e-7■□□□□ 9.8
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PRPF4O43172 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NRSN2-208ENST00000609179 578 ntTSL 314.47□□□□□ -0.096e-7■□□□□ 9.8
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PRPF4O43172 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.196e-7■□□□□ 9.8
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PRPF4O43172 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-7■□□□□ 9.8
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PRPF4O43172 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.061e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-204ENST00000473018 579 ntTSL 214.02□□□□□ -0.171e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-215ENST00000532509 825 ntTSL 514.02□□□□□ -0.171e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-216ENST00000534146 654 ntTSL 413.62□□□□□ -0.231e-9■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-207ENST00000525881 914 ntTSL 212.42□□□□□ -0.421e-9■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.12e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.12e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-217ENST00000534334 1149 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.111e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.452e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-9■□□□□ 9.7
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