Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHGR1C9JFL3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms