Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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