Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS37CA5D8V6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS37CA5D8V6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms