Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms