Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms